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台法合作研究橈足類在溫帶氣候（法國鄰近海域）與亞熱帶氣候（台灣附近海域）不同生態環境的生活史，行為與時空分佈特性及模式之三年期研究計畫(3/3)（國科會9705~9804.30）
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珊瑚污染生理生態研究（水產生物科技頂尖研究中心9601~9612）
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卯澳灣之海洋生物資源研究計畫（台北縣貢寮鄉卯澳社區發展協會9603~9612）
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（96-97）北部各核能電廠附近海域之生態調查（台灣電力股份有限公司9601~9612）
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龜山島海底熱泉湧出及擴散對此海域浮游動物生態及補添量之機制研究（國科會9608~9707）
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台法合作研究橈足類在溫帶氣候（法國鄰近海域）與亞熱帶氣候（台灣附近海域）不同生態環境的生活史，行為與時空分佈特性及模式之三年期研究計畫(2/3)（國科會9605~9704）
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「國立海洋科技博物館施工及營運期間環境監測及技術服務」海域生態調查工作（光宇工程顧問有限公司96011~9612）
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珊瑚污染生理生態研究（水產生物科技頂尖研究中心9503~9512）
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南海北部海域橈足類種類組成、時空分佈及攝食生態之三年期研究計畫（國科會9508~9607）
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墾丁國家公園南灣海域長期生態研究－整合與模式建構（II）─橈足類在墾丁珊瑚礁生態系之長期季節性監測與攝食效應研究（V）（國科會9508~9607）
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彰化濱海工業區開發工程95年度施工期間環境監測調查－螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司9501~9512）
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台法合作研究橈足類在溫帶氣候（法國鄰近海域）與亞熱帶氣候（台灣附近海域）不同生態環境的生活史，行為與時空分佈特性及模式之三年期研究計畫(1/3)（國科會9508~9607）
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94-95北部各核能電廠附近海域之生態調查（台灣電力股份有限公司9401~9512）
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彰化濱海工業區開發工程94年度施工期間環境監測調查－螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司9401~9412）
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橈足類在溫帶氣候（法國）與亞熱帶氣候（台灣）兩種不同生態環境的行為模式與時空分佈研究（國科會9402~9501）
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墾丁國家公園南灣海域長期生態研究－整合與模式建構（II）─墾丁珊瑚礁海域橈足類之長期季節性監測與攝食效應研究（IV）（國科會9408~9507）
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南海北部海域橈足類種類組成、時空分佈及攝食生態之研究（國科會9408~9507）
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墾丁珊瑚礁海域之長期生態研究─橈足類在墾丁珊瑚礁生態系之長期季節性監測與攝食效應研究（國科會9308~9407）
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彰化濱海工業區開發工程九十三年度施工期間環境監測調查－螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司9301~9312）
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以雷射光學科技研究浮游動物在變異化學環境中之三維游泳軌跡(教育部9308~9412)
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雷射光學技術的開發與應用作為分析浮游動物之行為歧異度並建立行為數值模式（與法國Lille科技大學合作）(教育部9208~9307)
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墾丁國家公園海域長期生態研究 -
整合與模式建構─橈足類在墾丁珊瑚礁生態系之長期季節性監測與攝食效應研究(3/3)（國科會9208~9307）
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彰化濱海工業區開發工程九十二年度施工期間環境監測調查－螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司9201~9212）
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北部各核能電廠附近海域之生態調查（台灣電力股份有限公司9201~9212）
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人工魚礁區效益調查及可行性評估（農委會9104~9112）
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墾丁國家公園海域長期生態研究 -
整合與模式建構─橈足類在墾丁珊瑚礁生態系之長期季節性監測與攝食效應研究(2/3)（國科會9108~9207）
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南海北部不同體型橈足類攝食速率與碳傳輸機制之研究（I）（國科會9108~9207）
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龜山島環島海洋生物與海底熱泉觀光資源調查規劃（交通部觀光局東北角海岸國家風景區管理處9106~9209）
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龜山島北岸碼頭位址周邊珊瑚分布調查（交通部觀光局東北角海岸國家風景區管理處9105~9111）
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螻蛄蝦棲息地可行性規劃（中興工程顧問股份有限公司9101~9112）
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九十至九十二年度淡水河系污水下水道系統營運期間環境品質監測計畫－海域生態調查暨海域水質、沉積物採樣暨重金屬分析工作計畫（中興工程顧問股份有限公司9008~9208）
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墾丁國家公園海域長期生態研究 -
整合與模式建構─橈足類在墾丁珊瑚礁生態系之長期季節性監測與攝食效應研究(2/3)（國科會9008~9107）
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彰濱工業區開發工程90年度下半年工期間環境監測－螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司9007~9012）
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南海生地化整合研究─子計畫五：南海橈足類攝食速率與碳傳輸之研究(Ⅲ)（國科會9008~9107）
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北部核能電廠及核能四廠附近海域之生態調查（台灣電力股份有限公司8909~9112）
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彰濱工業區開發工程88年度下半年與89年度施工期間環境監測(陸域部份)─螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司8901~9006）
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89年度「基礎科學」領域教學改進計畫－大學海洋生物與環境生物教學改進計畫（教育部顧問室8808~8906）
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南海生地化整合研究(I)—子計畫二 :
南海橈足類攝食速率與碳傳輸之研究（國科會8908~9007）
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南海浮游橈族類的季節與垂直分佈; 時間序列的初探（國科會8808~8907）
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台灣珊瑚礁保育研究--子計畫一:懸浮沉積物與重金屬對珊瑚之生存與復育之研究(I)（國科會8808~8907）
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彰濱工業區開發工程88年度施工期間環境影響調查之螻蛄蝦監測調查（中興工程顧問股份有限公司8801~8812）
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珊瑚礁保育計畫-珊瑚礁保育-熱
沈積物及重金屬之汙染源對珊瑚體行為與生態之衝擊研究-顯微光學技術之應用（3/3）（國科會8708~8807）
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南海季風實驗整合計畫－（子計畫二）南海橈腳類攝食速率之研究（國科會8708~8807）
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桃園科技工業區環境評估海域生態調查計畫 （亞朔開發股份有限公司8708~8812）
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北部核能電廠及核能四廠附近海域之生態調查(生物因子)
（台灣電力股份有限公司8709~8908）
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彰濱工業區開發工程87年度施工期間環境影響調查之螻蛄蝦監測調查 （中興工程顧問股份有限公司8701~8712）
